MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 93653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015554	ACGCTT	2	12	43	54	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015554	TTAA	2	8	105	112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015554	TCAA	2	8	225	232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015554	ATT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015554	TTG	2	6	526	531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015554	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015554	TTC	3	9	609	617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015554	GC	3	6	621	626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015554	GTT	2	6	653	658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015554	CAA	2	6	741	746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891491
11	NC_015554	GAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891491
12	NC_015554	GCT	3	9	948	956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891491
13	NC_015554	GCA	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891491
14	NC_015554	GTCA	2	8	1014	1021	25 %	25 %	25 %	25 %	333891491
15	NC_015554	AGTC	2	8	1041	1048	25 %	25 %	25 %	25 %	333891491
16	NC_015554	CAA	2	6	1131	1136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891491
17	NC_015554	ATA	2	6	1144	1149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891491
18	NC_015554	ACA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891491
19	NC_015554	GATCCC	2	12	1316	1327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333891491
20	NC_015554	TTAT	3	12	1461	1472	25 %	75 %	0 %	0 %	333891491
21	NC_015554	TGCA	2	8	1504	1511	25 %	25 %	25 %	25 %	333891491
22	NC_015554	AAT	2	6	1605	1610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891491
23	NC_015554	AGA	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891491
24	NC_015554	TTA	2	6	1653	1658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891491
25	NC_015554	TGA	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891491
26	NC_015554	TAA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891491
27	NC_015554	CTTT	2	8	1924	1931	0 %	75 %	0 %	25 %	333891491
28	NC_015554	GCTAAC	2	12	1992	2003	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333891491
29	NC_015554	GTC	2	6	2011	2016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891491
30	NC_015554	TTA	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891491
31	NC_015554	ATA	2	6	2089	2094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891491
32	NC_015554	ATT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891491
33	NC_015554	GAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891491
34	NC_015554	TGG	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891491
35	NC_015554	AGA	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891491
36	NC_015554	AGA	2	6	2324	2329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891491
37	NC_015554	A	6	6	2362	2367	100 %	0 %	0 %	0 %	333891491
38	NC_015554	AC	3	6	2467	2472	50 %	0 %	0 %	50 %	333891492
39	NC_015554	TC	3	6	2482	2487	0 %	50 %	0 %	50 %	333891492
40	NC_015554	ATT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891492
41	NC_015554	TCTA	2	8	2716	2723	25 %	50 %	0 %	25 %	333891492
42	NC_015554	AGA	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891492
43	NC_015554	TTGA	2	8	2807	2814	25 %	50 %	25 %	0 %	333891492
44	NC_015554	CAA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891492
45	NC_015554	GCA	2	6	2836	2841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891492
46	NC_015554	TAT	2	6	2852	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891492
47	NC_015554	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891492
48	NC_015554	ATT	2	6	2891	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891492
49	NC_015554	ACA	2	6	2951	2956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891492
50	NC_015554	TTA	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891492
51	NC_015554	T	6	6	3069	3074	0 %	100 %	0 %	0 %	333891492
52	NC_015554	TCG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891492
53	NC_015554	TAC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891492
54	NC_015554	ATT	2	6	3161	3166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891492
55	NC_015554	TCTT	2	8	3247	3254	0 %	75 %	0 %	25 %	333891492
56	NC_015554	TAA	2	6	3277	3282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891492
57	NC_015554	AAG	3	9	3291	3299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891492
58	NC_015554	GAA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891492
59	NC_015554	CGA	2	6	3331	3336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891492
60	NC_015554	CTTAT	2	10	3360	3369	20 %	60 %	0 %	20 %	333891492
61	NC_015554	ATTG	2	8	3436	3443	25 %	50 %	25 %	0 %	333891492
62	NC_015554	TGC	2	6	3448	3453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891492
63	NC_015554	TGC	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891492
64	NC_015554	ATT	2	6	3496	3501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891492
65	NC_015554	AT	3	6	3503	3508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015554	TATC	2	8	3514	3521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015554	TGG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015554	TTC	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015554	GCT	2	6	3558	3563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015554	TTA	2	6	3573	3578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015554	ATC	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891493
72	NC_015554	TAA	2	6	3764	3769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891493
73	NC_015554	AC	3	6	3770	3775	50 %	0 %	0 %	50 %	333891493
74	NC_015554	TTA	2	6	3781	3786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891493
75	NC_015554	GAA	2	6	3831	3836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891493
76	NC_015554	GAA	3	9	3865	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891493
77	NC_015554	GTA	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891493
78	NC_015554	AGTC	2	8	3929	3936	25 %	25 %	25 %	25 %	333891493
79	NC_015554	CAC	2	6	4123	4128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333891493
80	NC_015554	T	6	6	4151	4156	0 %	100 %	0 %	0 %	333891493
81	NC_015554	TA	3	6	4194	4199	50 %	50 %	0 %	0 %	333891493
82	NC_015554	ACA	2	6	4233	4238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891493
83	NC_015554	TAC	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891493
84	NC_015554	A	6	6	4317	4322	100 %	0 %	0 %	0 %	333891493
85	NC_015554	ATG	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891493
86	NC_015554	TTA	2	6	4413	4418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891493
87	NC_015554	GCG	2	6	4446	4451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333891493
88	NC_015554	TAAC	2	8	4486	4493	50 %	25 %	0 %	25 %	333891493
89	NC_015554	TCT	2	6	4504	4509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891493
90	NC_015554	GAT	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891493
91	NC_015554	TTAT	2	8	4554	4561	25 %	75 %	0 %	0 %	333891493
92	NC_015554	TGGATA	2	12	4573	4584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891493
93	NC_015554	GAAAA	2	10	4644	4653	80 %	0 %	20 %	0 %	333891493
94	NC_015554	CAGAA	2	10	4704	4713	60 %	0 %	20 %	20 %	333891494
95	NC_015554	GTAT	2	8	4776	4783	25 %	50 %	25 %	0 %	333891494
96	NC_015554	CAC	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333891494
97	NC_015554	GTT	2	6	4832	4837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891494
98	NC_015554	AC	3	6	4894	4899	50 %	0 %	0 %	50 %	333891494
99	NC_015554	ATG	2	6	4920	4925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891494
100	NC_015554	GAA	3	9	4955	4963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891494
101	NC_015554	TTA	2	6	4983	4988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891494
102	NC_015554	GAT	2	6	5018	5023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891494
103	NC_015554	GGTGTT	2	12	5054	5065	0 %	50 %	50 %	0 %	333891494
104	NC_015554	AGT	2	6	5068	5073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891494
105	NC_015554	TCG	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891494
106	NC_015554	ATT	2	6	5242	5247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891494
107	NC_015554	AG	3	6	5276	5281	50 %	0 %	50 %	0 %	333891494
108	NC_015554	CGAG	2	8	5323	5330	25 %	0 %	50 %	25 %	333891494
109	NC_015554	AGA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891494
110	NC_015554	AAG	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891494
111	NC_015554	ATG	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891494
112	NC_015554	CAA	2	6	5515	5520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891494
113	NC_015554	GGT	2	6	5537	5542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891494
114	NC_015554	TAA	2	6	5584	5589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891494
115	NC_015554	TGA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891494
116	NC_015554	TGT	2	6	5668	5673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891494
117	NC_015554	TTCTC	2	10	5699	5708	0 %	60 %	0 %	40 %	333891494
118	NC_015554	TCA	2	6	5729	5734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891494
119	NC_015554	CAG	2	6	5745	5750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891494
120	NC_015554	ATT	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891494
121	NC_015554	TGC	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891494
122	NC_015554	GCA	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891494
123	NC_015554	TA	4	8	5964	5971	50 %	50 %	0 %	0 %	333891494
124	NC_015554	CTG	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891494
125	NC_015554	TTC	2	6	6033	6038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891494
126	NC_015554	AAG	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891494
127	NC_015554	CGA	2	6	6145	6150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891494
128	NC_015554	ATT	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891494
129	NC_015554	TTC	2	6	6242	6247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891494
130	NC_015554	TTATAT	2	12	6280	6291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891494
131	NC_015554	GCC	2	6	6298	6303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333891494
132	NC_015554	A	6	6	6317	6322	100 %	0 %	0 %	0 %	333891494
133	NC_015554	GAT	3	9	6347	6355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891494
134	NC_015554	CA	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	333891494
135	NC_015554	TGA	3	9	6412	6420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891494
136	NC_015554	AGA	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891494
137	NC_015554	AGA	2	6	6556	6561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891494
138	NC_015554	TTG	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891494
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148	NC_015554	T	6	6	7198	7203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015554	TTACAC	2	12	7235	7246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015554	TCC	2	6	7269	7274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_015554	C	9	9	7306	7314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
152	NC_015554	A	8	8	7315	7322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015554	GTA	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015554	AGTG	2	8	7385	7392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015554	ATA	2	6	7404	7409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015554	AGA	3	9	7418	7426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015554	TTA	2	6	7442	7447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015554	CGC	2	6	7468	7473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_015554	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015554	TTAA	2	8	7574	7581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015554	ATA	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015554	A	8	8	7615	7622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015554	AGC	2	6	7682	7687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_015554	ATA	2	6	13123	13128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015554	AAT	2	6	13165	13170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015554	A	6	6	13211	13216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015554	CTT	2	6	13358	13363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_015554	TAT	3	9	13396	13404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015554	AAT	2	6	13466	13471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_015554	CAA	2	6	13493	13498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_015554	TTAA	2	8	13499	13506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015554	AT	3	6	13516	13521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015554	TCG	2	6	13575	13580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891501
273	NC_015554	CAT	2	6	13604	13609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891501
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277	NC_015554	CTT	2	6	13924	13929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891501
278	NC_015554	CTGT	2	8	13936	13943	0 %	50 %	25 %	25 %	333891501
279	NC_015554	TGC	2	6	14048	14053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891501
280	NC_015554	AC	4	8	14125	14132	50 %	0 %	0 %	50 %	333891501
281	NC_015554	AACA	2	8	14136	14143	75 %	0 %	0 %	25 %	333891501
282	NC_015554	T	6	6	14147	14152	0 %	100 %	0 %	0 %	333891501
283	NC_015554	ATA	2	6	14154	14159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891501
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285	NC_015554	GAT	2	6	14390	14395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891502
286	NC_015554	ACTC	2	8	14458	14465	25 %	25 %	0 %	50 %	333891502
287	NC_015554	TCA	2	6	14514	14519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891502
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293	NC_015554	AAAG	2	8	14990	14997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015554	GA	3	6	15026	15031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015554	AT	3	6	15049	15054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015554	TTTAAG	2	12	15111	15122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015554	TTTC	2	8	15137	15144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
298	NC_015554	A	7	7	15174	15180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015554	AAT	2	6	15260	15265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015554	A	6	6	15270	15275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015554	TAA	2	6	15290	15295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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310	NC_015554	GGTA	2	8	15670	15677	25 %	25 %	50 %	0 %	333891503
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352	NC_015554	TGG	2	6	18215	18220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
353	NC_015554	ATAA	2	8	18242	18249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_015554	ATC	2	6	18254	18259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
355	NC_015554	TAA	2	6	18279	18284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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357	NC_015554	T	9	9	18428	18436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_015554	TTA	2	6	18492	18497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
359	NC_015554	T	8	8	18502	18509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
360	NC_015554	TCGGC	2	10	18547	18556	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
361	NC_015554	AGG	2	6	18564	18569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_015554	GTG	2	6	19109	19114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891504
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371	NC_015554	GTA	2	6	19258	19263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
372	NC_015554	TAA	2	6	19314	19319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_015554	CTG	2	6	19408	19413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891505
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380	NC_015554	TTGG	2	8	19937	19944	0 %	50 %	50 %	0 %	333891505
381	NC_015554	ATG	2	6	20014	20019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891505
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383	NC_015554	GCA	2	6	20109	20114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891505
384	NC_015554	ATCA	2	8	20276	20283	50 %	25 %	0 %	25 %	333891505
385	NC_015554	TAC	2	6	20285	20290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891505
386	NC_015554	TAC	2	6	20341	20346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891505
387	NC_015554	GGC	2	6	20391	20396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333891505
388	NC_015554	GT	4	8	20410	20417	0 %	50 %	50 %	0 %	333891505
389	NC_015554	GTA	2	6	20514	20519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891505
390	NC_015554	CTT	2	6	20534	20539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891505
391	NC_015554	GGT	2	6	20552	20557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891505
392	NC_015554	TACCGC	2	12	20615	20626	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333891505
393	NC_015554	GTG	2	6	20712	20717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891505
394	NC_015554	GTT	2	6	20750	20755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891505
395	NC_015554	TCAG	2	8	20805	20812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
396	NC_015554	AGA	2	6	20841	20846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891506
397	NC_015554	CTT	2	6	20892	20897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891506
398	NC_015554	CGT	2	6	20923	20928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891506
399	NC_015554	AGGT	2	8	21083	21090	25 %	25 %	50 %	0 %	333891506
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402	NC_015554	GCA	2	6	21149	21154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891506
403	NC_015554	GCTT	2	8	21155	21162	0 %	50 %	25 %	25 %	333891506
404	NC_015554	C	6	6	21173	21178	0 %	0 %	0 %	100 %	333891506
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